Les différents pôles d'activités de l'église, dénommés "Groupes de Ministère", ont pour but :

• De permettre à l’église d’être au bénéfice des dons du plus grand nombre de ses membres,
• De donner aux chrétiens la possibilité de servir là où ils se sentent appelés par Dieu,
• D’éviter que la vie de l’église soit l’affaire uniquement d’une élite ou d’un petit groupe de personnes,
• D’être une église « équilibrée », et éviter de favoriser un aspect de la vie de l’église plus qu’un autre.

Chaque groupe est administré par un délégué et un sous-délégué sous couvert d’un ancien « référent » 

L’Eglise Protestante Evangélique de Dunkerque Petite-Synthe encourage chaque membre à faire partie d’un ou plusieurs groupes.